新世纪之初，国家问题重重，失业率升高，少年犯罪多发。失去自信开始恐惧孩子们的大人们通过了一项法令“BR”——每年要在全国的中学中选出一个最糟糕的班，把全班学生放到电脑控制下无法逃脱的无人岛，在三天内互相残杀，只准一人生还。这一年，岩城学园3年纪B组的学生们被选中了。陷入极限状态的学生们纷纷开始采取行动。有杀死朋友的人，也有与恋人一起自动放弃生命的人。其中，七原秋也和一同在孤儿院长大的好友国信庆时决心一起守护暗中爱慕的中川典子。3天后，七原和中川两人都活了下来，但是法律规定只能有一人生还……

已经饱和的世界经济给亚洲各国带来了空前的经济萧条。新世纪伊始，有一个国家彻底崩溃了，完全失业率超过了15%，一千万失业者遍及全国各地。失去了生存自信的大人们开始威胁天真无邪的孩子们。全国有80万儿童、学生拒绝上学。学校内的教师又受到学生的暴力行为，殉职者人数高达1200人。就在这个时候，一条新的法律出台了。 　　BR法案是《新世纪教育改革法》的通称。所谓BR法案，就是为了解消公民对学校的崩溃、对卑劣少年的恶性犯罪引起的愤恨；为了培养青少年们在逆境中排除各种困难，并由此获得坚韧不拔的生存能力；使青少年们从大人们手里夺回原本就属于他们的权利。 　　从全国的初中3年级中，每年随机地选出一个班级，并把学生们送往受行动范围限制的、荒无人烟的地方。发给每个学生地图、粮食、各种各样的武器，让他们自相残杀，直到只留下最后一个为止。时间限度为3天。学生们必须佩戴违反规定即自行爆炸的特殊项圈。在此期间的学生杀人、致人伤害、持带枪械等违法行为都不受法律限制。 　　城岩学园3年级B班被选中了，给每一个人发放了各种各样的凶器，同时发放的还有会自行引起爆炸的项圈。在与世隔绝的无人岛上，42名中学生在抛洒鲜血的三天时间里，突然间，不合情理的一幕出现了…… 　　在三天时间里，要把其他同学全部杀掉，自己才能生存，在这种极限环境下，42名中学生为维护自己的青春年华，而不惜余力地夺去他人的生命。

从全国中学三年生中选出被认为是最不良的一个班级，令其所有成员在一起自相残杀直至仅余最后一人存活的游戏法则——新世纪教育改革法，通称“BR”。 　　三日之内，要么将身边所有同伴杀死，要么等着自己被杀，道路残酷而唯一。而当年最终从这种极限状态中脱逃，残活下来的人，他们后来如何？ 　　在七原秋也与中川典子从BR中脱身，离开孤岛的两年之后，人类世界进入了恐怖主义时代。首都在反BR国家的“恐怖分子”手下被炸为废墟，政府当局将这次事件的凶犯判定为七原，并开始了对其的国际通缉。 　　首都崩坏之后一年……七原做为反BR法组织“wild seven”的领袖，对所有的成人发布了宣战通告。成人们为了剿杀七原，便籍着反恐的正义之名，计划了一次新游戏——新世纪反恐对策特别法，通称BRⅡ。 　　这样的背景之下，某天，汇集了来自全国各地的不良少年，以及逃课问题生的鹿之砦中学校的3年B组42名孩子，在圣诞节休学旅行通往滑雪学校的路途中，沦为了军队的劫持目标，被全员绑架到了一座孤岛之上。当他们被勒令换上军服，并押送集合至一个巨大军营之内时，他们的指导教师RIKI却出现了。“整个班级无一人例外，将成为本次BRⅡ的参加者”，RIKI向已经陷入混乱的学生们，公布了绑架理由，并说明了BRⅡ的游戏规则。