故事中的三个主人公小飞、鼠妹、胖胖是侦查队的优秀老鼠侦查员。他们有各自的绝招，小飞擅长体术，追捕的速度极快，身体也十分灵活；鼠妹机智聪明，能想出各种对付坏人的妙招；胖胖贪吃爱睡，但在危急关头总能意想不到地救了大家。这个完美组合接手了一项重要任务——探索神秘莫测的海底世界。三人穿着特制的潜水服深入海底 ，向居住在海底的生物传达来自人类友好的问候，并帮助他们解决环境和生存方面的问题。三人将他们每天的所见所闻记录在《老鼠笔记》上，这本厚厚的《老鼠笔记》帮助人们了解另一个未知的世界，那里有色彩斑斓的鱼群和藻类，同样也暗藏杀机，日记中记载了令人震惊的“厄尔尼诺现象”、华丽壮观的“海火”和恐怖诡异的“食肉海绵”等内容，为人类和海洋世界的沟通提供了一个重要窗口。

心理咨询师黄晓军涉嫌对女客户性骚扰被投诉后遭到停职，但随后他的导师吴教授又为他介绍了一个叫赵立华的精神分裂症状病人。黄晓军发现赵在幻觉下，会通…